Melalui implementasi rencana Pengelolaan Pesisir Terpadu (PPT), Program ATSEA-2 akan berkontribusi terhadap peningkatan pengelolaan perikanan dan sumber daya pesisir lainnya untuk mata pencaharian masyarakat, penyediaan nutrisi, dan kesehatan ekosistem.
ATSEA-2 mendukung upaya-upaya lokal, regional dan nasional melalui kombinasi analisis, pelatihan, dukungan, pengumpulan informasi dan rencana aksi regional. Kegiatan yang dijadwalkan untuk masing-masing keluaran adalah sebagai berikut:
Perbaikan Pengelolaan Perikanan
Mengadopsi Pengelolaan Perikanan Berbasisi Ekosistem atau Ecosystem Approach to Fisheries Management (EAFM)
Mendukung upaya untuk mengurangi penangkapan ikan yang illegal, tidak dilaporkan dan tidak sesuai aturan (Illegal, Unreported and Unregulated, IUU)
Pengurangan Polusi Laut
Menyelesaikan analisis tentang hotspot polusi regional
Memperkuat sistem peringatan dini tumpahan minyak pada skala lokal dan regional
Menyediakan pelatihan bagi masyarakat lokal yang terpilih
Perlindungan Habitat dan Spesies
Mengumpulkan informasi tentang ekosistem laut di wilayah ATS
Mengidentifikasi kawasan konservasi prioritas
Mendukung kawasan konservasi perairan yang sudah ada dan yang akan diusulkan
Membuat rencana aksi regional untuk melindungi penyu dan dugong yang terancam punah
PPT yang menggabungkan adaptasi perubahan iklim
Melindungi sekitar 125km garis pantai di Indonesia dan Timor Leste
Mendukung implementasi rencana PPT
Mendukung adaptasi perubahan iklim di desa-desa pesisir yang berisiko